一、基本信息
英文称号:H-Ala-D-Glu(Lys-D-Ala-D-Ala-OH)-OH
中语称号:丙氨酰 - D-γ- 谷氨酰 - 赖氨酰 - D - 丙氨酰 - D - 丙氨酸(中语名可能因定名法例及民俗存在其他表述)
氨基酸序列:从 N 端至 C 端为丙氨酸 - D-γ- 谷氨酰胺 - 赖氨酸 - D - 丙氨酸 - D - 丙氨酸 ,即 Ala - D - γ - Glu - Lys - D - Ala - D - Ala 。在肽聚糖前体结构中,它以特定策划神气参与组成更大分子结构,其中 γ- 谷氨酸的 γ- 羧基参与肽键酿成 。
单字母序列:A - D - γ - E - K - D - D
三字母序列:Ala - D - γ - Glu - Lys - D - Ala - D - Ala
分子量:488.535
分子式:C₂₀H₃₆N₆O₈
等电点:约 9.71 。该多肽含有多个可解离基团,其中赖氨酸的 ε- 氨基(pKa 约 10.5)呈碱性,天冬氨酸的羧基(pKa 约 4.0)呈酸性,通过关连计较模子,勾引这些氨基酸的 pKa 值以及多肽所处环境,可估算出其等电点。当环境 pH 为等电点时,多肽举座呈电中性 。
张开剩余80%CAS 号:2614 - 55 - 3
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二、结构信息
Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 是由 5 个氨基酸残基组成的短肽。在一级结构上,氨基酸通过肽键循序衔接,酿成线性结构 。与常见多肽不同的是,其谷氨酸残基为 D 型且是 γ- 羧基参与肽键酿成,而超过见的 α- 羧基,这种零散策划神气影响了肽链的空间走向 。
从二级结构看,由于肽段较短,难以酿成典型的 α- 螺旋、β- 折叠等法例二级结构。但氨基酸残基间可通过氢键、范德华力等弱相互作用,产生局部构象倾向,如可能酿成一些 β- 转角结构,使肽链出现袭击 。
三级结构中,带正电的赖氨酸残基和带负电的 D-γ- 谷氨酸残基的侧链基团相互作用,会影响肽链的折叠神气,同期丙氨酸的甲基侧链也会影响分子的空间填充和举座方法 。举座而言,其结构特色与细菌肽聚糖前体结构细密关连,在肽聚糖合成流程中,该五肽尾可与其他肽聚糖身分(如 N - 乙酰胞壁酸等)策划,构建起复杂的肽聚糖网状结构 。
三、作用机理及磋商进展
作用机理:Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 是肽聚糖前体 UDPMurNAc-l-Ala-γ-d-Glu-l-Lys (Gly)(5)-d-Ala-d-Ala 的五肽尾 。在细菌细胞壁合成流程中,它参与肽聚糖的拼装。领先,UDP-N - 乙酰胞壁酸五肽(含此五肽尾)与 N - 乙酰葡萄糖胺勾引酿成双糖亚单元,随后这些双糖亚单元在细胞膜上安谧团聚,并通过转肽作用酿成交联的肽聚糖网状结构,赋予细菌细胞壁强度和褂讪性 。此外,它已经 D - 丙氨酸羧肽酶(muramoylpentapeptide carboxypeptidease)的底物,该酶可催化其 C 端 D - 丙氨酸的水解,在细菌细胞壁代谢及看护细胞壁结构完满性方面阐发作用,影响细菌的孕育、诀别等生理流程 。
磋商进展:刻下对 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 的磋商多集结在细菌细胞壁合成机制界限。通过对其在肽聚糖合成道路中的作用磋商,有助于久了相识细菌细胞壁的构建流程,为建树新式抗菌药物提供表面基础 。有磋商欺诈同位素绚丽时候跟踪该五肽尾在肽聚糖合成中的代谢旅途,明确其参与肽聚糖拼装的具体方法和环节酶促响应 。在抗菌药物研发方面,以搅扰该五肽尾参与的肽聚糖合成流程为靶点,筛选和蓄意大致阻碍关连酶活性(如转肽酶、D - 丙氨酸羧肽酶等)的化合物,有望建树出新式抗菌药物,处置日益严重的细菌耐药问题,但现在关连药物仍处于磋商阶段,距离临床应用还有诸多问题需要处置,如药物的安全性、灵验性、药代能源学性格等 。
四、融解保存
融解:
体外本质融解:可尝试使用无菌超纯水融解,若融解性欠安,可计划使用二甲基亚砜(DMSO)。但需防止,DMSO 可能对某些生物本质产生影响,使用前应进行对照本质评估 。在一些酶活性检测本质中,还可把柄本质要求将其融解于特定缓冲液,如磷酸盐缓冲液(PBS,pH7.4),以看护合适的 pH 值和离子强度,保证多肽的褂讪性和生物活性 。
体内本质关连融解(动物本质等应用):关于体内应用,常将其融解于生理缓冲液,如生理盐水(0.9% NaCl 溶液)或与体内环境更接近的缓冲体系。同期,要防止溶液的无菌处理,细心微生物混浊,影响本质恶果 。
保存:
干粉保存:遥远保存时,将 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 以冻干粉风物置于密封容器中,存放在 - 20°C 或更低温度(如 - 80°C)环境下,可减少多肽降解,延迟保存时刻。同期,防止避光,幸免光照激发可能的化学响应 。
溶液保存:若配制成溶液,需进行分装,幸免反复冻融,因为冻融轮回可能导致多肽结构结巴、活性缩短。在 - 20°C 条目下,溶液可保存数月;在 - 80°C,保存时刻可合适延迟,但具体时长会因保存条目和溶液身分略有互异 。从雪柜取出溶液使用时,应顷然离心,使溶液集结于管底,再开启取用,细心溶液蒸发和混浊 。
五、关连多肽
革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌肽聚糖四肽尾关连多肽:革兰氏阳性菌肽聚糖四肽尾组成一般为 L-Ala + D-Glu + L-Lys + D-Ala ,革兰氏阴性菌为 L-Ala + D-Glu + m-DAP(内消旋二氨基庚二酸) + D-Ala 。与 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 对比,它们在氨基酸种类和罗列上既有一样性又有互异,磋商这些互异有助于相识不同类型细菌细胞壁结构及合成机制的特色 。
基于肽聚糖合成道路的其他环节多肽:如 UDP-N - 乙酰胞壁酸五肽中,除了包含 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 这一五肽尾的风物外,还有不同氨基酸组成或修饰的五肽尾变体,磋商这些变体多肽在肽聚糖合成中的作用及与 Ala-D-γ-Glu-Lys-D-Ala-D-Ala 的相互关系,可进一步显着肽聚糖合成道路的复杂性和千般性 。
六、关连文件
[1] Foley TD赌真钱老虎机app娱乐, et al. Oxidative inhibition of protein phosphatase 2A activity: role of catalytic subunit disulfides. Neurochem Res. 2007 Nov;32 (11):1957 - 64.
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